COMPLEX AARDAPPELGENOM VERDER ONTHULD

Wetenschappers van Solynta en Wageningen University & Research (WUR) hebben de meest complete genoomsequentie voor aardappelen tot nu toe gepubliceerd. Uniek is dat zowel sequentie als plantaardig materiaal (onder bepaalde voorwaarden) beschikbaar wordt gesteld voor onderzoek. Dit kan in de toekomst resulteren in een aardappel die beter bestand is tegen hitte of droogte of een grotere weerstand heeft tegen ziekten.

De aardappel is wereldwijd een van de belangrijkste voedselgewassen. Verbeteringen aan de eigenschappen ervan kunnen daarom een ​​grote impact hebben. Het aflezen van de genoomstructuur van de aardappel is echter uiterst lastig, aangezien een gewone aardappel uit vier genomen bestaat, waardoor het moeilijk is om de positie van de genen te bepalen. Het recente onderzoek paste een diploïde echte aardappelplant toe met slechts één genoom, een zogenaamde homozygoot, die het gemakkelijker maakt om de DNA-basesequentie af te lezen en te vergelijken. Deze plant, Solyntus, is geproduceerd als onderdeel van Solynta's hybride aardappelveredelingsprogramma.

Van 125,000 tot 185 segmenten
Richard Visser, hoogleraar bij de afdeling Plantenveredeling aan de WUR, is enthousiast over de nieuwe sequentie: “De voorheen beschikbare genoomsequentie, die ik ook heb helpen vaststellen, bestond uit ongeveer 125,000 kleine segmenten. Het genoom dat we nu presenteren bestaat uit 185 grote segmenten. Dit is een aanzienlijke verbetering die werd bereikt door een combinatie van uniek plantmateriaal en nieuwe sequentie- en analysetechnieken. Terwijl de vorige reeks een wilde variëteit van de aardappel betrof, hebben we nu een echte aardappelplant gebruikt. Ik hoop – en verwacht – dat ons werk uiteindelijk zal leiden tot een efficiënter en sneller aardappelveredelingsproces.”

Ook Solynta's R&D-directeur Pim Lindhout is blij met de samenwerking: “Dit concrete resultaat van een publiek-private samenwerking bewijst dat we samen sneller nieuwe panden kunnen omschrijven en ontwikkelen. Twee jaar geleden lieten we zien dat we binnen twee jaar een aardappelplant kunnen maken die ziekteresistent is. Deze laatste doorbraak betekent dat we ook andere eigenschappen sneller kunnen verkennen en benutten. Ik ben ervan overtuigd dat dit veel sneller zal leiden tot een meer duurzame aardappelteelt.”

Sneller en gerichter fokken
Verschillende onderzoeksprojecten binnen WUR gebruiken zowel de plant als de sequentie, waardoor wetenschappers experimentele resultaten kunnen koppelen aan de genetische code. De zeer nauwkeurige genoomsequentie maakt een snellere en meer gerichte veredeling mogelijk, omdat in het DNA gemakkelijker te vinden is welke kruisingen met andere rassen interessant kunnen zijn, en waar de uitwisseling van genetisch materiaal tussen 'vader' en 'moeder' idealiter zou moeten plaatsvinden. spelen zich af. Zo weten wetenschappers in een vroeg stadium of de aardappel de gewenste eigenschappen heeft, zoals resistentie tegen bepaalde ziekten.

Het onderzoek is mede gefinancierd door PepsiCo en draagt ​​daarmee bij aan een duurzamere voedselketen. SolyntusTM is een handelsmerk dat voortkomt uit Solynta's hybride aardappelveredelingsprogramma.

Een bron: https://www.solynta.com/